Jan Piotrowski urodził się 5 stycznia 1953 r.oku w Szczurowej, która jest jednocześnie jego parafią rodzinną. Po ukończeniu szkoły średniej w Radłowie i złożeniu egzaminu dojrzałości, wstąpił do Wyższego Seminarium Duchownego w Tarnowie. Święcenia przyjął w Bazylice Katedralnej w Tarnowie z rąk biskupa tarnowskiego Jerzego Ablewicza 25 maja 1980 roku.
Po święceniach pracował w parafii Przecław i parafii pw. Ducha Świętego w Mielcu. W latach 1984-1991 pełnił posługę misyjną w Republice Konga w Afryce. Po powrocie został mianowany sekretarzem krajowym Papieskiego Dzieła św. Piotra Apostoła, a w 1995 roku sekretarzem krajowym Papieskiego Dzieła Rozkrzewiania Wiary.
Z kolei w roku 1992 podjął studia specjalistyczne w Instytucie Katolickim w Paryżu i otrzymał tytuł licencjata z teologii. Doktorat z teologii uzyskał w Akademii Teologii Katolickiej w Warszawie na podstawie rozprawy „Zakładanie i dojrzewanie Kościoła w Kongijskiej Krainie Grand Niari (druga ewangelizacja 1883-1991)”.
W latach 1997-1999 podjął, z krótką przerwą (w czasie której pełnił obowiązki kierownika administracyjnego Katolickiego Ośrodka Studiów Społecznych w Lipnicy Murowanej, a po śmierci proboszcza administratora miejscowej parafii), posługę duszpasterską w jednym z ubogich przedmieść Limy, stolicy Peru.
W latach 2000-2010 pełnił z nominacji Kongregacji ds. Ewangelizacji, funkcję dyrektora krajowego Papieskich Dzieł Misyjnych w Polsce. Ponadto 24 marca 2003 roku papież Jan Paweł II mianował go członkiem Kongregacji ds. Ewangelizacji Narodów. W czerwcu 2001 roku Konferencja Episkopatu Polski powołała go na konsultora Komisji ds. Misyjnych.
Od 22 listopada 2009 roku pełnił urząd proboszcza parafii św. Małgorzaty w Nowym Sączu. Był dziekanem dekanatu Nowy Sącz-Centrum oraz prepozytem Kapituły Kolegiackiej w Nowym Sączu, a także członkiem Diecezjalnej Rady Duszpasterskiej oraz Rady Kapłańskiej.
W dowód uznania za gorliwą posługę kapłańską Ojciec Święty Jan Paweł II obdarzył go w dniu 26 stycznia 2004 roku godnością Kapelana Jego Świątobliwości.
14 grudnia 2013 roku Ojciec Święty Franciszek mianował ks. dra Jana Piotrowskiego, biskupem pomocniczym diecezji tarnowskiej, przydzielając mu stolicę tytularną Siniti. 25 stycznia 2014 roku w katedrze tarnowskiej ks. Jan Piotrowski przyjął sakrę biskupią. Głównym konsekratorem był bp Andrzej Jeż, a towarzyszyli mu abp Celestino Migliore, nuncjusz apostolski w Polsce, oraz biskup senior Władysław Bobowski.
11 października 2014 roku Ojciec Święty Franciszek mianował go nowym Biskupem Kieleckim. 28 listopada 2014 roku kanoniczne objął rządy w diecezji kieleckiej, a dzień później odbył Ingres do Bazyliki Katedralnej.
